近日,人工智能領(lǐng)域頂級(jí)學(xué)術(shù)會(huì)議發(fā)布了ICML 2025論文審稿結(jié)果,北京分子之心科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱分子之心)與香港理工大學(xué)聯(lián)合研究成果“針對(duì)特定底物的檢索增強(qiáng)零樣本酶生成”被大會(huì)收錄。
分子之心創(chuàng)始人許錦波介紹,該研究首創(chuàng)性地實(shí)現(xiàn)了針對(duì)自然界從未見(jiàn)過(guò)的分子或生物反應(yīng)按需生成專屬催化物,它們?cè)诖呋?、穩(wěn)定性等關(guān)鍵指標(biāo)上優(yōu)于天然酶和傳統(tǒng)方法設(shè)計(jì)的酶,這一技術(shù)或在生物醫(yī)藥、生物制造等領(lǐng)域產(chǎn)生重要價(jià)值。
許錦波解讀,酶的局限性成為了生物制造領(lǐng)域亟須打破的瓶頸。有調(diào)研數(shù)據(jù)顯示,“缺乏理想生物催化劑”是生物產(chǎn)業(yè)規(guī)模化生產(chǎn)的主要障礙,僅制藥、化工、農(nóng)業(yè)領(lǐng)域因酶限制導(dǎo)致的年產(chǎn)能損失就已超過(guò)千億美元。
近年來(lái),興起的AI蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)為酶精準(zhǔn)生成創(chuàng)造了可能性。AI方法可以通過(guò)學(xué)習(xí)大量已知酶的結(jié)構(gòu)—功能關(guān)系來(lái)直接生成新的催化劑,這使得從頭設(shè)計(jì)具有特定催化功能的酶成為可能。但由于AI的訓(xùn)練高度依賴于已知的酶-底物配對(duì)數(shù)據(jù),面對(duì)全新的人造分子時(shí),AI模型常常會(huì)因缺乏訓(xùn)練數(shù)據(jù)而陷入“盲區(qū)”。
“但是,真正的產(chǎn)業(yè)痛點(diǎn),不僅僅是優(yōu)化已知酶,還要‘從無(wú)到有’地創(chuàng)造出理想的新酶?!痹S錦波指出。
針對(duì)新酶生成的核心難題,即在沒(méi)有直接催化數(shù)據(jù)的條件下生成酶,分子之心聯(lián)合香港理工大學(xué),融合生物信息大數(shù)據(jù)檢索與生成式AI,提出一種全新的AI酶設(shè)計(jì)方法“SENZ”。相關(guān)成果被人工智能頂會(huì)ICML收錄。
許錦波介紹,研究團(tuán)隊(duì)將SENZ的設(shè)計(jì)結(jié)果與多種主流酶設(shè)計(jì)方法進(jìn)行了對(duì)比,數(shù)據(jù)顯示,SENZ生成的酶顯著優(yōu)于基線和天然酶。
“未來(lái)三年,我們將把‘按需設(shè)計(jì)’能力擴(kuò)展至抗體、疫苗、工業(yè)酶等領(lǐng)域?!痹S錦波稱,分子之心將持續(xù)鍛造設(shè)計(jì)生物分子的AI新引擎,為應(yīng)對(duì)健康、環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展的重大挑戰(zhàn)提供全新的“生物解決方案”。
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